Анализ ДНК ПЦР для каждого с помощью аппарата Open qPCR

Не так давно мне попалась на глаза очень интересная разработка под названием Open qPCR для проведения анализа ДНК, можно сказать в домашних условиях. Здесь я хочу написать, что с помощью ПЦР амплификатора Open qPCR вы сможете делать.

Особенности амплификатора Open qPCR

Прибор появился и получил поддержку на краудфандинговом сервисе Kickstarter здесь. Сейчас его можно заказать на сайте chaibio.com. Основная идея, которую преследовали разработчики этого решения, - это сделать технологии анализа ДНК доступными для всех, включая врачей в развивающихся странах, учащихся в старших классах и университетских лабораториях, компании пищевой промышленности и разного рода исследователей.

Приборов подобного рода вы можете найти в продаже очень много, но этот экземпляр особенный. За 1899 или 2599 долларов вы получите кроме самого прибора программное обеспечение, которое интерпретирует полученные данные и представляет результаты в виде чётких положительных и отрицательных результатов для конечных пользователей (см. картинку). Первая цена указана для однодиапазонного прибора, а вторая – для двухдиапазонного. Обе версии прибора работают с флуорофорами, такими как FAM, в диапазоне 510-545 нм. Вторая версия прибора дополнительно может обнаруживать HEX/VIC/JOE флуорофоры в диапазоне 560-610 нм.

Внутри Open qPCR работает встроенный веб-сервер, и управлять прибором вы будете прямо из вашего браузера, подключившись через Ethernet или Wi-Fi. Простой и понятный пользовательский интерфейс создан с использованием технологии HTML5. Также поддерживается USB-подключение при отсутствии сети.

Что вы можете делать с помощью Open qPCR

- Генотипирование: определение ваших возможностей в спорте, генетические наследственные свойства, такие как мутации гена BRCA связанные с раком молочной железы, селекция животных на основе желаемых генотипов.

- Безопасность пищевых продуктов: идентификация кишечной палочки, листерии или сальмонеллы в пищевых продуктах, отслеживание качества воды с помощью выявления патогенных и индикаторных микроорганизмов, обнаружение конины в гамбургере или мяса дельфина в тунце.

- Исследования: анализ уровня экспрессии генов в клетках, получение немедленной обратной связи о работе ПЦР без необходимости использования геля, проектирование биологических систем путём обработки и перегруппировки ДНК.

- Здоровье: обнаружение вирусов, таких как ВИЧ и лихорадка Эбола, проверка насекомых, являющихся переносчиками таких болезней, как малярия или вирус Западного Нила.

Характеристики Open qPCR

Амплификатор Open qPCR содержит 16 ячеек для пробирок 100 или 200 мкл. Тепловой блок рампы 0 - 100 °С, 5 °С/сек, что позволяет многим ПЦР процедурам завершиться уже через 30 минут.

Сенсорный экран разрешением 800x400 позволит легко управлять прибором, помимо управления с помощью браузера через USB, Ethernet или Wi-Fi. Работает аппарат при помощи встроенного микрокомпьютера BeagleBone Black с процессором 1 GHz и 4GB Flash под управлением ОС Linux.

Open qPCR совместим с системами питания по всему миру (110-240 вольт, 47-63 Гц) и соответствует всем требованиям СЕ и FCC. В нормальном режиме работы прибор расходует 250 Вт, а в специальном режиме пониженной мощности, анализ ДНК может выполняться расходуя всего лишь 45 Вт, что позволяет использовать солнечные батареи или аккумуляторы для работы в полевых условиях.

В заключении об амплификаторе Open qPCR

Прибор Open qPCR действительно может быть интересен тем, кто занимается анализом ДНК в научных или образовательных целях. Сейчас на сайте производителя доступен предзаказ прибора. С каждым прибором вы получите стартовый набор реагентов, с помощью которого сможете произвести 50 исследований. Позже вы сможете использовать реагенты сторонних производителей.

А всем кто заинтересовался прибором Open qPCR, возможно будет интересен и другой ещё более дешёвый (всего 599 долларов) амплификатор от тех же калифорнийских создателей – OpenPCR, почитать про который можно здесь.